在分子生物学实验中，核酸电泳是最基础也最关键的检测手段之一。面对琼脂糖凝胶和 PAGE 凝胶，你真的选对了吗？两种凝胶体系看似相似，实则原理、分辨率、适用范围差异巨大。选错了，实验结果可能“白费功夫”。
• 基质：天然海藻多糖，形成大孔径凝胶。
• 原理：主要依靠孔径筛分效应，大分子迁移慢，小分子迁移快。
• 优点：制备简单、操作快捷、韧性好，支持切胶回收。
• 适用场景：快速检测、大片段 DNA 分离。
• 基质：聚丙烯酰胺，孔径极小且可调控。
• 原理：结合分子筛效应与电荷效应，分辨率极高。
• 优点：可区分1~10 bp 的微小差异。
• 缺点：制胶繁琐、毒性风险、胶体脆、不易回收。
• 适用场景：高精度分析、小片段核酸。
首选琼脂糖凝胶
• 常规 PCR 产物检测（片段 > 200 bp）
• 质粒抽提鉴定（超螺旋、线性、开环）
• 基因组 DNA 或总 RNA 完整性检测
• 酶切产物快速鉴定
• 需要切胶回收的实验
首选 PAGE 凝胶
• 引物、siRNA、miRNA 等小分子核酸
• SSR、AFLP 等高精度指纹分析
• 单碱基差异检测（如突变分析）
• 测序前片段筛选（如 NGS 文库质控）
• 琼脂糖凝胶：使用新鲜 TAE/TBE 缓冲液，避免反复加热导致凝胶浓度不均。
• PAGE 凝胶：注意丙烯酰胺完全聚合，上样量不宜过高（否则条带变形）。
• 染色：Gel Red / Gel Green 灵敏度高，优于 EB。
• Marker 选择：务必匹配样本大小范围，避免“跑出胶”或“挤在底部”。
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📌 跑小片段核酸（比如100 bp 以下）时，你是选择高浓度琼脂糖还是直接上 PAGE？有没有踩过坑？
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